第二军医大学卫生勤务学系创建于1955年，是全军唯一的卫生勤务专业系，是军队卫生管理干部和地方公共卫生人才的培养基地。全系现有教授10名，副教授18名，其中博士生导师8名，硕士生导师9名，拥有一批国内军内知名的专家教授。先后成立“世界卫生组织/热带病临床数据管理中心”、“军队卫生事业管理研究所”、“全军心理卫生研究中心”、“第二军医大学循证医学与数据处理中心”，建有“卫勤指挥模拟实验室”、“卫勤决策支持实验室”、“心理咨询与治疗实验室”等军内重点实验室。近年来获国家自然基金重点项目等科研课题113项，经费5531万元。先后取得国家科技进步二等奖、军队科技进步一等奖、上海市科技进步一等奖、军队教学成果一等奖等一批高等级教学科研成果。共发表SCI论文73篇，其中两篇在国际著名期刊《柳叶刀》上发表。